植物分子生理学研究平台共有设备29台（套），总价值近五千万元。主要有冷冻超薄切片机、组织切片仪-全自动轮转式切片机、透射电子显微镜、活体植物体内实时分子标记成像仪、实时荧光定量PCR仪、LED三色光植物培养箱、红外光谱测定仪、LED三色光植物培养箱、代谢物质谱成像系统、液相色谱-质谱（LC-MS）联用仪、超高分辨率共聚焦显微镜、双光子荧光寿命显微镜、二维液相色谱—高分辨串联质谱仪、气质联用仪、气相色谱-高分辨串联质谱联用仪、流式细胞仪、生物分子相互作用仪Biacore T200等，可为植物蛋白质组学研究、植物代谢组学研究和细胞生物学研究提供检测分析，是一个细胞学与组学研究的专业支撑平台。

    植物蛋白质组学方向可开展高通量蛋白质定性定量分析、各类型蛋白质翻译后修饰的定性定量分析、蛋白质二硫键等蛋白质结构分析、生物大分子精确分子量测定、化学发光成像与数据分析、蛋白质-蛋白质相互作用及其动力学解析、蛋白质与其他生物分子或小分子的相互作用解析、多分子复合物的组装分析等；

    代谢组学研究方向可对植物组织或细胞在特定生理时期内低分子量(一般指MW<1000)代谢产物进行解析；对经过初步分离的复杂植物组织中的小分子化合物进行准确的定性和定量的研究；通过建立标准的方法，建立植物小分子代谢物的快速定性检测方法，确定生理病理相关的植物小分子标志物；通过对植物样品进行提取、纯化、衍生等前处理，对其体内痕量和超痕量植物激素，主要包括生长素、脱落酸、茉莉酸、水杨酸、赤霉素（含量ng/g甚至pg/g）进行测定；

    细胞生物学研究方向可以进行微米到纳米尺度的观察。平台可以使用光学显微镜借助荧光技术解析各亚细胞结构的定位和动态变化，实现多维采集、三维重建，完成FRAP、FRET实验；可以提供透射电镜技术的全方位支持；可以对各种植物细胞、悬浮液、微生物等进行细胞基因、蛋白、功能水平的研究和不同细胞之间的差异化研究，并对目标群体分选。